MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Exiguobacterium sibiricum 255-15 plasmid pEXIG01

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010549	AG	3	6	81	86	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010549	AGA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010549	GAA	2	6	142	147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010549	ATC	2	6	169	174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010549	AAGG	2	8	195	202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010549	AGG	2	6	224	229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010549	GAA	2	6	242	247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059054
8	NC_010549	AACA	2	8	282	289	75 %	0 %	0 %	25 %	172059054
9	NC_010549	CAA	2	6	381	386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172059054
10	NC_010549	AAG	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059054
11	NC_010549	GAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059054
12	NC_010549	GAT	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059054
13	NC_010549	ATT	2	6	573	578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172059054
14	NC_010549	A	6	6	582	587	100 %	0 %	0 %	0 %	172059054
15	NC_010549	CTTGAT	2	12	594	605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	172059054
16	NC_010549	AC	3	6	629	634	50 %	0 %	0 %	50 %	172059054
17	NC_010549	TA	3	6	690	695	50 %	50 %	0 %	0 %	172059054
18	NC_010549	GAA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059054
19	NC_010549	GGT	2	6	775	780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172059055
20	NC_010549	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172059055
21	NC_010549	TCAA	2	8	852	859	50 %	25 %	0 %	25 %	172059055
22	NC_010549	ATT	3	9	957	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172059055
23	NC_010549	ATA	2	6	1008	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172059055
24	NC_010549	GTA	2	6	1036	1041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059056
25	NC_010549	ATA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172059056
26	NC_010549	T	6	6	1147	1152	0 %	100 %	0 %	0 %	172059056
27	NC_010549	TTA	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172059056
28	NC_010549	TTC	2	6	1540	1545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059056
29	NC_010549	CTT	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059056
30	NC_010549	TTC	2	6	1660	1665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059056
31	NC_010549	ATGA	2	8	1669	1676	50 %	25 %	25 %	0 %	172059056
32	NC_010549	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059056
33	NC_010549	AGT	2	6	1693	1698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059056
34	NC_010549	AGT	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059056
35	NC_010549	CCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010549	AAATG	2	10	1821	1830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010549	T	6	6	1838	1843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010549	A	6	6	1858	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010549	A	7	7	1925	1931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010549	T	6	6	1970	1975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010549	T	7	7	1984	1990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010549	TTTA	2	8	2001	2008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010549	T	7	7	2035	2041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010549	TGC	2	6	2044	2049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010549	ATCT	2	8	2052	2059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010549	AAAG	2	8	2123	2130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010549	GCTAG	2	10	2214	2223	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010549	ATC	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010549	ATA	2	6	2351	2356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010549	CTT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010549	T	6	6	2374	2379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010549	CTTT	2	8	2461	2468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010549	A	7	7	2484	2490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010549	ACAAT	2	10	2517	2526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010549	AT	3	6	2560	2565	50 %	50 %	0 %	0 %	172059057
56	NC_010549	CTT	2	6	2570	2575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059057
57	NC_010549	T	6	6	2574	2579	0 %	100 %	0 %	0 %	172059057
58	NC_010549	CAA	2	6	2609	2614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172059057
59	NC_010549	ATT	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172059057
60	NC_010549	TCA	2	6	2695	2700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172059057
61	NC_010549	GTT	2	6	2701	2706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172059057
62	NC_010549	TTG	2	6	2726	2731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172059057
63	NC_010549	ATT	2	6	2748	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172059057
64	NC_010549	TAG	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172059057
65	NC_010549	TCA	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172059057
66	NC_010549	TAA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172059057
67	NC_010549	A	7	7	2848	2854	100 %	0 %	0 %	0 %	172059057
68	NC_010549	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	172059057
69	NC_010549	T	6	6	2915	2920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010549	A	6	6	2942	2947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010549	GTAC	2	8	3073	3080	25 %	25 %	25 %	25 %	172059058
72	NC_010549	AGA	3	9	3170	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059058
73	NC_010549	AAT	2	6	3263	3268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172059058
74	NC_010549	CTT	2	6	3277	3282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059058
75	NC_010549	A	7	7	3299	3305	100 %	0 %	0 %	0 %	172059058
76	NC_010549	TTAG	2	8	3315	3322	25 %	50 %	25 %	0 %	172059058
77	NC_010549	TCT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059058
78	NC_010549	TTC	2	6	3385	3390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059058
79	NC_010549	CTGGTG	2	12	3397	3408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	172059058
80	NC_010549	AAG	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172059058
81	NC_010549	ACG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059058
82	NC_010549	AGC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172059058
83	NC_010549	A	6	6	3567	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	172059058
84	NC_010549	TCT	2	6	3600	3605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172059058
85	NC_010549	A	6	6	3717	3722	100 %	0 %	0 %	0 %	172059058
86	NC_010549	TAA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172059058
87	NC_010549	TA	3	6	3765	3770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010549	TAG	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010549	A	6	6	3818	3823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010549	ATG	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010549	ACGG	2	8	3932	3939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010549	AAC	2	6	3940	3945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010549	A	6	6	3946	3951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010549	GAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010549	CAT	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010549	ATG	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010549	TTTTG	2	10	4185	4194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010549	GTC	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010549	TAG	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010549	ACG	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010549	GCA	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010549	TG	3	6	4552	4557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010549	GCCT	2	8	4722	4729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010549	A	7	7	4776	4782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010549	ACG	2	6	4813	4818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010549	AGG	2	6	4847	4852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010549	AGCGA	2	10	4854	4863	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.